El 6 de septiembre de 1929 se fundó formalmente la Società Sportiva Littorio Benevento en la ciudad homónima de la Campania. La creación del club fue liderada por un grupo de entusiastas del deporte dirigidos por el directivo Don Francesco Minocchia, con el objetivo de dotar a la ciudad de una estructura competitiva formal para participar en los torneos oficiales regionales de la Federación Italiana de Fútbol (FIGC). Los fundadores construyeron, con el apoyo y mano de obra de los propios futbolistas y vecinos del distrito de Libertà, el campo original de 'Santa Maria degli Angeli' (renombrado posteriormente como Estadio Meomartini) para albergar los partidos del naciente conjunto, que adoptó la camiseta a bastones verticales amarillos y rojos en honor a los colores comunales.
El 30 de abril de 2016, el Benevento de Gaetano Auteri rompió una sequía de casi nueve décadas sin jugar en el fútbol profesional de plata. Al vencer en la penúltima jornada 3-0 al Lecce en un repleto Estadio Ciro Vigorito gracias a los goles de Fabio Mazzeo (doblete) y Amato Ciciretti, la escuadra giallorossa aseguró el primer puesto absoluto del Grupo C y el histórico ascenso directo a la Serie B.
En la temporada 2016-2017, la escuadra campana protagonizó una de las mayores hazañas del Calcio moderno al clasificar a los play-offs de ascenso a la máxima categoría. Tras sortear las fases previas, los dirigidos por Marco Baroni derrotaron 1-0 al Carpi en el partido de vuelta de la final el 8 de junio de 2017 en el Estadio Vigorito con gol de George Puscas, logrando un inédito doble ascenso consecutivo a la Serie A.
El 3 de diciembre de 2017 quedó registrado como uno de los momentos más singulares de la historia del Calcio. Tras acumular 14 derrotas consecutivas en su debut en la Serie A, el Benevento se medía al Milan. En el minuto 95, con el marcador 1-2 adverso, el arquero Alberto Brignoli subió al área rival y conectó un espectacular remate de cabeza que decretó el empate final 2-2, otorgando el primer punto oficial en la máxima categoría al club.
Durante la temporada 2019-2020, el equipo giallorosso dirigido por Filippo Inzaghi completó una campaña récord en la segunda categoría. El equipo dominó el torneo con una superioridad aplastante, consagrándose campeón y sellando el ascenso a la Serie A con siete jornadas de anticipación el 29 de junio de 2020 al vencer 1-0 al Juve Stabia, igualando el récord histórico del Ascoli de 1978.