El club fue fundado oficialmente el 1 de noviembre de 2012 en la ciudad de Limache, Región de Valparaíso. La creación de la entidad se gestó como una iniciativa local tras la disolución y desafiliación del antiguo Club Deportivo Municipal Limache en 2008, situación que había dejado a la comuna sin representatividad en el fútbol federado. El proceso fundacional fue liderado y financiado principalmente por los empresarios locales Aldo Torres Benzi y Rodolfo Eberlein, quienes articularon el proyecto para recuperar la plaza deportiva. Tras su constitución legal y conformación directiva, la institución fue aceptada por la Asociación Nacional de Fútbol Amateur (ANFA) para debutar en el campeonato de la Tercera División B durante la temporada 2013, adoptando el color rojo y negro, e instituyendo el Estadio Municipal Gustavo Ocaranza como su sede inicial.
Durante la temporada 2020 de la Tercera División A, el club logró obtener el campeonato de la categoría amateur tras superar a Rodelindo Román en la final del certamen. Este resultado marcó el primer ascenso del equipo al fútbol profesional chileno, siendo aceptados por la Asociación Nacional de Fútbol Profesional (ANFP) para integrar la Segunda División Profesional a partir de la temporada 2021, estableciendo su localía en el Estadio Municipal Gustavo Ocaranza.
En el marco del campeonato de Segunda División 2023, bajo la dirección técnica de Víctor Rivero, el equipo finalizó en la primera ubicación de la tabla de posiciones con 53 puntos. El club aseguró matemáticamente el título y el ascenso directo en la fecha 22, al derrotar por 3-0 a Real San Joaquín. La campaña les permitió clasificar por primera vez en su historia a la categoría de Primera B del fútbol nacional.
El año 2024 marcó el debut institucional en la segunda categoría del fútbol profesional de Chile. Durante esta primera temporada en la Primera B, el equipo registró una campaña sostenida que les permitió competir por los puestos de clasificación a la liguilla de ascenso. Esta campaña afianzó su posición deportiva dentro del profesionalismo, requiriendo trasladar sus partidos de alta convocatoria al Estadio Nicolás Chahuán Nazar de la ciudad vecina de La Calera debido a los requerimientos de aforo de la división.
La consolidación deportiva del club culminó en la temporada 2025 al concretar su ascenso oficial a la máxima categoría del fútbol profesional chileno, la Primera División. Este logro representó la conclusión de una rápida escalada deportiva desde las categorías amateurs inferiores hasta la élite del balompié nacional en un período de doce años desde su fundación institucional, estableciéndose como un representante estable de la Región de Valparaíso.