K.V. Mechelen es uno de los clubes participantes de la Jupiler Pro League de Bélgica.
El Football Club Malinois fue fundado oficialmente el 26 de octubre de 1904 en la ciudad de Malinas, provincia de Amberes. Impulsado por empresarios locales y clérigos de la diócesis liderados por el canónigo Hubert, el club se unió a la federación nacional bajo la matrícula federativa N° 25 y adoptó los colores rojiamarillos. La principal motivación original consistió en consolidar una asociación de fútbol de orientación católica e identidad flamenca que compitiera con el ya existente Racing Club de Malines, tradicionalmente ligado a los sectores liberales y laicos de la ciudad.
Durante la década de los cuarenta, el Malinas instauró su primera gran dinastía dominadora en los torneos nacionales, obteniendo tres campeonatos de Primera División en las temporadas 1942-43 (46 puntos en 30 partidos), 1945-46 (50 puntos en 36 encuentros) y 1947-48 (43 puntos en 30 jornadas). La gran figura de este equipo de época fue el artillero Albert De Cleyn, quien convirtió un total de 377 goles oficiales en 488 partidos disputados en su carrera en el club, una marca histórica y un récord absoluto de anotación que sigue vigente en el fútbol profesional de Bélgica.
El 11 de mayo de 1988, el Malinas firmó la página más gloriosa de toda su trayectoria histórica al consagrarse campeón de la Recopa de Europa de la UEFA en la final disputada en Estrasburgo frente al Ajax de Ámsterdam al imponerse por 1-0 gracias a un gol de cabeza de Piet den Boer al minuto 53. Dirigidos por Aad de Mos y con Michel Preud'homme en la portería, los rojiamarillos sumaron la Supercopa de Europa en febrero de 1989 al batir al PSV Eindhoven por un global de 3-1 (victoria 3-0 en Malinas con doblete de John Bosman y gol en contra de Valckx; y derrota 1-0 en Eindhoven).
En la campaña liguera de la Primera División 1988-89, el Malinas conquistó el cuarto título liguero de su historia en la Pro League belga. Exhibiendo el mismo orden defensivo de alta disciplina que le valió el reconocimiento europeo, el equipo rojiamarillo sumó un total de 57 puntos en 34 partidos disputados (25 victorias, 7 empates, 2 derrotas) con 64 goles a favor y solo 20 en contra, superando por cuatro unidades al Anderlecht (53 puntos) en la clasificación, consolidando la era dorada más importante en la trayectoria de la institución.
El 1 de mayo de 2019, inmerso en complejas disputas judiciales que lo forzaron a competir en la Segunda División de Bélgica, el KV Mechelen firmó una de las mayores hazañas modernas del fútbol belga al consagrarse campeón de la Copa de Bélgica. De la mano del técnico Wouter Vrancken, la escuadra derrotó en la gran final al KAA Gent por un marcador de 2-1 en Bruselas, con anotaciones de Nikola Storm al 38' y de Germán Mera al 62' de juego (el único gol de Gante fue obra de Jean-Luc Dompé al 32'), logrando el ascenso en el mismo certamen.