Club representativo de la ciudad de Río Cuarto, fundado a partir de alumnos escolares. Popularmente conocido como 'El León', es uno de los máximos exponentes del sur cordobés, habiendo participado en los Torneos Nacionales de Primera División en la década de 1980 y afianzado en la Primera Nacional en la era moderna.
El 21 de septiembre de 1912, como consecuencia de una escisión deportiva producida en el 'Centro de Estudiantes y Biblioteca Bernardino Rivadavia', un grupo de alumnos pertenecientes al Colegio Nacional N.º 1 de Río Cuarto conformó la Asociación Atlética Estudiantes. La flamante entidad estableció a Juan Francisco Remedi como su primer presidente directivo. Desde su origen, la institución determinó la utilización de los colores celeste y blanco para conformar su identidad visual y la indumentaria de sus equipos deportivos.
Luego de destacarse sistemáticamente en los torneos organizados por la Liga Regional, la institución logró adjudicarse las plazas correspondientes para participar en los Campeonatos Nacionales de la Asociación del Fútbol Argentino durante tres temporadas consecutivas (1983, 1984 y 1985). Esta experiencia representó la primera integración del conjunto riocuartense en competiciones regulares de Primera División frente a los principales equipos del fútbol profesional argentino.
El 23 de enero de 2018, en el marco de una serie eliminatoria correspondiente a la Copa Argentina disputada frente a Sportivo Belgrano, se produjo el último encuentro oficial del mediocampista Pablo César Aimar. El exfutbolista del seleccionado nacional, quien se había iniciado deportivamente en las divisiones formativas de la institución, determinó finalizar su carrera profesional actuando para Estudiantes de Río Cuarto junto a su hermano Andrés Aimar.
Durante la temporada 2018-2019 del Torneo Federal A, Estudiantes completó una campaña regular que le permitió acceder al hexagonal final de la competencia. El equipo logró el campeonato de la tercera división al superar a Sarmiento de Resistencia en el encuentro decisivo, asegurando de este modo el ascenso directo a la Primera Nacional. Este logro deportivo estableció la consolidación del club en la segunda categoría del fútbol argentino profesional.
En el desarrollo del Torneo de Transición de la Primera Nacional, correspondiente a la temporada 2020-2021, la institución alcanzó un destacado rendimiento deportivo que le permitió acceder a dos instancias finales para lograr el ascenso a la máxima categoría de la AFA. El equipo disputó los encuentros decisivos frente a Sarmiento de Junín y el Club Atlético Platense, resultando superado en ambas ocasiones a través de la definición por tiros desde el punto penal, concretando un registro histórico para la entidad.